先天性巨结肠通过手术能治疗好，先天性巨结肠主要是由于基因遗传或环境因素共同作用造成，手术一般可根治，但是也有可能会出现并发症。
先天性巨结肠常见于乙状结肠、直肠，主要是由于受累肠管出现痉挛、狭窄，引起肠道蠕动功能障碍，导致肠内容物在肠道内堆积、无法排出，从而引起病变肠道严重扩张，最终形成巨结肠改变的一种病变。该疾病的治疗方法以手术为主，手术原则主要为切除狭窄段或丧失正常功能的近端结肠，以保证术后达到正常的排便功能。
术后家长应保持患儿肛门清洁，便后可以使用清水或生理盐水等清洁肛门，注意及时擦干。另外需培养患儿定时排便习惯，每次排便尽量排空，如连续2天未排便，可遵医嘱使用开塞露通便。另外在日常生活中，应及时观察患儿大便性质，防止腹泻。