临床上多数骨髓炎可以治好。急性骨髓炎及早给予抗感染处理，给予抗生素治疗，或辅助超短波治疗，或者辅助外科开窗减压、引流，可控制急性骨髓炎。

慢性骨髓炎因人而异，有一定复发率，病程较长、较复杂，患者常有低度感染，彻底清除病原微生物，需破坏更多骨组织，但会破坏骨组织的支架作用。