肾囊肿微创手术以后，大多数没有明显的后遗症，但是对于比较大的囊肿，或者恶性囊肿来说，手术的后遗症有可能就比较明显。针对肾脏囊肿，主要是根据囊肿的个数、囊肿的大小、囊肿的部位来决定如何治疗。如果单侧的肾囊肿超过3个、大小〉5cm、向内生长，这种情况下一般需要治疗。治疗的手术也分为三种，第一种是穿刺抽囊液打硬化剂，第二种是去顶减压术，第三种是囊肿的切除。

通常情况下，微创手术是肾脏、肾囊肿治疗的主流微创手术，因为它的创伤很小，所以说一般不会有明显的后遗症。但是对于比较大的囊肿，或者是恶性的囊肿，切除的范围可能就比较大，有可能会造成病人肾功能的损害。甚至有些人做完手术以后，会出现血肌酐升高等，这些也要注意。