真菌性肺炎感染可具有咳嗽、咳痰、发热、痰中带血，或者伴有胸痛的症状，具有支气管肺炎的各种症状和体征，但是起病缓慢，往往在抗生素治疗中咳嗽症状加重，肺部听诊也可听到细湿啰音，真菌性肺炎一般多见于滥用抗生素，以及大量使用激素和免疫抑制剂的患者。发现真菌性肺炎一般多在痰培养和痰涂片中，可出现白色假丝酵母菌、念珠菌，以及其他真菌菌丝生长，便可诊断真菌性肺炎。

治疗真菌性肺炎需要立即停用广谱抗生素，以及激素类和免疫抑制剂药物，患者应使用抗真菌药物，如氟康唑、伊曲康唑等药物，必要时需要根据痰的真菌培养结果，选择敏感、有效的抗真菌药物治疗。真菌性肺炎也可出现其他的感染病灶，比如鹅口疮或皮肤、消化道部位可见真菌病。