近视准分子手术的优点，在于对于符合手术条件的患者，做完手术之后视力都会得到提高，患者不用再配戴框架眼镜来提高视力，有利于患者的工作和生活，无疑对近视眼患者来说有很大帮助。只要严格的把握好手术适应证，并且术后患者遵照医嘱用药，近视准分子手术也是非常安全的。

缺点在于有小部分患者可能会合并有后遗症，近视准分子手术之后，部分患者可以合并眼睛干涩的症状。这主要是由于近视准分子手术会切断角膜前基质层内的感觉神经丛，从而导致反射性泪液分泌相应减少。在术后早期，可以导致患者合并干眼症，但是患者经过时间的推移，大部分人可以恢复。大部分患者做完近视准分子手术之后，可以保持良好的屈光状态，但是部分患者由于自身的原因或者用眼过度不当，可以导致近视度数的反弹。另外，也可能会合并眩光、复视、夜间视觉质量差等症状。