卵巢囊肿5公分，如果发生了意外怀孕，也是根据囊肿的情况来进行选择。如果考虑囊肿为良性的囊肿可能性比较大，也可以选择继续妊娠。如果囊肿增长比较迅速，并且囊肿内有乳头样的突起，伴有明显的血流信号，而且肿瘤标志物也升高，怀孕以后会引起肿瘤的播散，甚至肿瘤进展比较迅速，这种情况需要进行手术治疗。但是临床工作中发现大多数的卵巢囊肿都为良性的囊肿，所以存在5公分卵巢囊肿的患者发生了意外怀孕，可以选择进行怀孕的过程中随访观察，主要是观察囊肿的增大情况。

在早期避免剧烈的运动，预防卵巢囊肿扭转，如果出现卵巢囊肿扭转，属于急腹症，需要紧急行手术治疗，避免囊肿扭转以后引起卵巢组织坏死，导致紧急切除卵巢等情况的发生。大多数患者卵巢囊肿5公分时可以进行随访观察，在观察过程中，主要是明确囊肿的生长速度、囊肿内是否有明显的变化，以及妊娠以后，患者是否有发生因为囊肿而引起的流产等情况。综合这些因素考虑，卵巢囊肿5公分的患者大多数情况下可以进行继续妊娠，但前提是在妊娠的过程中需要密切的随访和观察。