脑栓塞和脑血栓都属于缺血性脑卒中。脑栓塞和脑血栓的病因略有不同，引起脑栓塞的原因，主要是由于脑子以外部分的栓子脱落，造成的血管堵塞，称为脑栓塞，比较常见的原因有两个方面，一方面是由于心源性的因素造成的，有房颤、心律失常，导致心脏的栓子脱落引起的脑梗，称为脑栓塞。还有就是大动脉、颈动脉栓子脱落引起的脑梗，都称为脑栓塞。病因不同，而脑血栓主要是由于血管硬化、狭窄、斑块等等，在脑血管上逐步地形成血栓，这种称为脑血栓形成。

病因略有区别，后续的治疗没有多大的区别，主要是通过，如果在短时间内形成，可以通过溶栓取栓的方法进行治疗，一般脑栓塞的溶栓效果欠佳，因为栓子是外在的，包括一些陈旧性的栓子，溶栓效果欠佳，而脑血栓溶栓效果会比较好。后续的取栓对于脑栓塞的患者，相对来说比较有大的意义，可以通过机械方法取栓，而改善因为脑栓塞造成的脑梗。脑血栓可以通过溶栓加上取栓，可能达到更好的效果。后续的预防的药物不一样，脑栓塞一般用抗凝药物来治疗。脑血栓形成一般用抗血小板聚集的药物进行治疗，改善症状，康复的治疗没有多大区别。