男性患尖锐湿疣时一般症状并不明显，少数可能有疼痛、瘙痒的感觉。多容易发生在外生殖器以及肛门周围的皮肤黏膜湿润的区域，外生殖器主要容易发生在龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎和会阴。一开始皮损可能会是单个、多个或者成群的淡红色小颗粒，主要表现质地柔软，顶端稍尖锐，所以被称为尖锐湿疣，有时很小，以至于用肉眼无法识别。

对于非常小的肉眼无法识别的尖锐湿疣可以通过醋酸白试验来鉴别，目前也可以借助于皮肤镜检查来确定诊断，皮疹的后期可以逐渐增多增大，形态可以变成乳头状、菜花状、鸡冠状，颜色也可以是白色的、粉红色的或者是乌黑色，表面也可以糜烂、渗液、破溃甚至于出血以及感染，极少数可能出现巨大的尖锐湿疣。多数患者因为没有明显的自觉症状，所以有时不容易感觉到有尖锐湿疣的存在。