全飞秒手术后的干眼症，绝大多数患者可以恢复。在全飞秒手术后的早期，有些患者可以伴随出现眼睛干涩的症状，可能是患了干眼症。全飞秒手术会切断角膜前基质层内的感觉神经丛，在术后早期可以导致角膜知觉减退。角膜知觉的减退可以导致瞬目反射减少，从而导致基础分泌泪液减少，在早期可以引发干眼症。但是随着时间推移，大部分人的干眼症状可以恢复。

在术后的1-3个月的时间，患者可以使用人工泪液缓解眼睛干涩等不适症状，也可以使用促泌剂，例如地夸磷索钠来促进泪液的分泌，以及黏蛋白的分泌，从而提高泪膜的稳定性。全飞秒激光手术较准分子激光手术而言，是利用飞秒激光完成的手术，对角膜的生物力学改变少。全飞秒激光手术后发生干眼症的概率，也较准分子激光手术低。即便全飞秒激光手术后有些患者出现干眼症的症状，但是随着时间推移，绝大部分患者可以恢复至正常。