囊状淋巴管瘤的治疗方法，主要包括保守治疗、注射疗法和手术治疗，部分囊状淋巴管瘤当病变比较小的时候，在发展过程中有可能自行栓塞、退化，也就是具有自然消退的趋势，或者是在感染之后由于囊壁内皮细胞的破坏，在感染被控制之后，可以逐渐自行消退。所以对于比较小而且局限的囊状淋巴管瘤，不影响病人功能、又不妨碍美观时，可以不进行治疗。

但是对于病变比较广泛的囊状淋巴管瘤，还是应该给予积极处理。注射疗法是处理囊状淋巴管瘤的重要手段，可以局部注射硬化剂治疗，也可以应用抗肿瘤的化疗药物博来霉素进行局部注射，能够取得比较满意的疗效。在注射之后，囊状淋巴管瘤完全消退和显著缩小的概率可以达到70%左右。此外，手术切除的治疗仍然是治疗囊状淋巴管瘤的主要治疗方法，尤其是当囊状淋巴管瘤压迫气管、食管或者压迫和侵犯纵隔部位，可能会引起严重的并发症事件，这个时候手术切除治疗较为有效。