巧克力囊肿确实很难怀孕，特别是双侧的卵巢都有巧克力囊肿的时候。巧克力囊肿会影响卵巢的正常功能，影响它的排卵，所以会导致很难受孕。同时，患有卵巢巧克力囊肿时，如果囊肿比较大，患者可能会出现一侧或者两侧的下腹坠痛、痛经等症状，所以也影响患者的性生活，这些都会影响女性怀孕。女性患有巧克力囊肿时，如果囊肿较小或者只有一侧囊肿，可以定期复查。只要女性月经正常，没有明显临床症状，一侧卵巢能够正常排卵，对女性怀孕影响不大。因为只要一侧卵巢正常排卵，患者就有受孕概率。如果卵巢双侧都有巧克力囊肿，患者月经出现不正常，或者出现痛经等症状时，建议如果患者有备孕要求，一定要及时用激素类药物或者是手术等来进行治疗以后再备孕，这样可以大大提高受孕概率。