多囊卵巢综合征多起病于青春期，主要的临床表现包括月经失调、雄激素过高以及肥胖。月经失调为最主要的临床表现，主要表现为月经稀发，甚至闭经。闭经前，一般经常是先有月经量减少，或者是月经稀发，也可能会出现不规则子宫出血，月经周期或者是经期及经量，完全没有规律性，从而导致生育期的妇女因为排卵障碍，而出现不孕。

另外由于高雄激素血症，导致不同程度的多毛，阴毛浓密，且呈男性倾向，油脂性皮肤以及痤疮也比较常见。另外一大部分的多囊卵巢综合征患者，会伴有明显的肥胖，主要是腹部肥胖，肥胖和胰岛素抵抗、雄激素过多，游离睾酮比例增加，以及瘦素抵抗，都有一定的关系。还可能会出现黑棘皮症，表现为阴唇、颈背部、腋下、乳房下以及腹股沟等处，皮肤的褶皱部位，出现灰褐色的色素沉着，皮肤增厚。