生殖细胞肿瘤常见于卵巢和睾丸的生殖细胞肿瘤，其中卵巢细胞肿瘤的晚期可以出现下腹部不适或者盆腔下坠的感觉，可以伴有进食减少、恶心、胃部不适等胃肠道的症状。如果卵巢生殖细胞肿瘤伴有恶性的腹水，可以出现腹部膨胀的感觉，甚至会因为严重的腹胀而导致腹部疼痛。由于肿瘤的压迫和腹水的压迫，病人可以出现呼吸困难、不能平卧、心悸、气短的症状。如果压迫膀胱，可以导致排尿困难。压迫直肠，可以引起肛门下坠感和大便的改变。此外，由于肿瘤的迅速增长，病人可以表现为营养不良和体力状态的明显下降，可以出现贫血、低白蛋白血症和消瘦的情况，严重的病人甚至有恶病质的表现。

睾丸生殖细胞瘤的晚期，可以在睾丸部位发现明显的肿块，这种肿块可以导致睾丸有沉重下坠和牵拉的感觉，在跳跃、跑步、站立过久的时候，症状可以明显地加重。有的病人还可以伴有疼痛的症状，甚至出现类似急性睾丸炎或者附睾炎的症状。当睾丸的生殖细胞肿瘤发生腹膜后的转移，转移的淋巴结可以互相融合成比较大的团块，可以压迫邻近的组织、血管和神经丛，也可以压迫胃肠道，产生各种压迫的症状。比如可以出现腰背部酸痛，下肢水肿等。