结核治疗是以抗结核治疗为主的综合治疗。化学治疗是现在结核治疗的最主要的基础治疗，简称化疗。其他治疗方法如对症治疗、手术治疗以及中医治疗，均为辅助治疗。

化疗的目的不仅是杀菌和防止耐药性的产生，而且在于最终灭菌，防止和杜绝复发。当前国际公认的化疗原则是早期、联合、适量、规律、全程。抗结核药物按效力和不良反应大小分为两类。一线抗结核药，指疗效好，不良反应少，如链霉素、异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇。二线抗结核药，效力或者安全性不如一线药物，在一线药物耐药或者不良反应不能耐受时被选用，包括卡那霉素、阿米卡星、对氨基水杨酸、左旋氧氟沙星、莫西沙星等。除了抗结核药物治疗以外，还可以进行手术治疗，以及对症治疗。

药物治疗失败或威胁生命的单侧肺结核，特别是局限性病变，如一侧肺毁损，不能控制的大咯血等，可以采取外科手术治疗。对症治疗，如糖皮质激素抗感染治疗，有助于改善肺结核病的严重的毒血症状。另外，结核还可以采取中医治疗，中医治疗可以扶正固本，提高患者的免疫力，对结核也有一定的效果。