肝囊肿的大小差距比较悬殊，小则几毫米，大者几十厘米。通常小的肝囊肿不会有任何临床症状，但是肝囊肿增大时可能会出现肝脏肿大，因此可能会出现右上腹不适腹胀、腹部钝痛或者腹部包块。如果合并感染，还可能会出现发热、疼痛，如果囊肿出血或者扭转，还可能会出现急性的腹部剧烈疼痛。

因为大多数的肝囊肿是没有临床症状的，所以一般不容易被发现。通常是在体检时或者因为其他疾病进行腹部影像学检查时，或者是腹部手术探查时发现肝内囊肿。肝囊肿通常可以通过肝脏影像学检查，如超声检查、CT检查，或者是X线检查明确诊断。肝囊肿是肝脏良性疾病，当肝囊肿比较小、没有症状时一般无需治疗，定期随访就可以。如果囊肿比较大、压迫症状比较明显，可以行囊肿开窗术治疗，必要时还需要术后置管引流，绝大多数肝囊肿预后情况比较好。