绝大多数的肝囊肿是因为先天原因而导致。由于胚胎时期胆管发育异常造成，由不与胆道系统相连的胆管形成。

少数的肝囊肿，是后天获得性的肝囊肿。通常可能与创伤、炎症有关，有少部分肝囊肿还可能是由于肝包层引起。多囊性肝囊肿一般认为是由于异常的胆管被保留下来，和胆道系统脱离逐渐扩大形成囊肿。也有人认为是胆道纤毛的缺陷，导致胆管细胞过度地增殖形成囊肿。肝囊肿是一种常见的良性的肝疾病。肝囊肿一般是圆形或者椭圆形，大小差别比较悬殊，直径可以从几毫米到几十厘米不等。绝大多数的肝囊肿没有临床症状，当体积增大或者是压迫重要组织时，可能会出现腹胀、腹部不适，或者是出现右上腹腹痛、腹部包块、肝大等表现。

超声检查是检查肝囊肿的首选方法，无创而且简便，可以显示囊肿部位、大小和形态结构。对于小而无症状的肝囊肿，定期随访就可以，通常不需要治疗。