糜烂性胃炎治疗应尽可能针对患者 病因、遵循个体化治疗原则。若患者合并有幽门螺杆菌感染推荐的铋剂四联根除方案：PPI(质子泵抑制剂)+铋剂+两种抗菌药物，疗程为10-14天，推荐抗生素有阿莫西林、呋喃唑酮、四环素、甲硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星。服用非甾体类抗炎药等药物引起胃黏膜损伤者，首先应根据患者使用药物治疗目的，评估是否可以停用该药物，对于必须长期服用者应进行HP(幽门螺杆菌)筛查并根除，根据病情或症状严重程度选用质子泵抑制剂、H2受体拮抗剂或胃黏膜保护剂。

胆汁反流也是糜烂性胃炎的病因之一，胆汁反流入胃可削弱或破坏胃黏膜屏障功能，遭到消化液作用从而产生炎性反应、糜烂、出血和上皮化生等病变。患者可以服用促胃动力药，如盐酸伊托必利、莫沙必利和多潘立酮等可防止或减少胆汁反流，铝碳酸镁制剂有结合胆酸作用，增强胃黏膜屏障功能，从而减轻或消除胃黏膜损伤，此外，有条件的患者可短期服用熊去氧胆酸制剂。