钩端螺旋体病的首选治疗药物为青霉素。钩端螺旋体病是由钩端螺旋体侵入人体而形成的急性传染病，钩端螺旋体侵入人体后，早期在血液中大量繁殖，形成败血症，出现感染中毒症状。中期钩端螺旋体侵入内脏器官，造成机体不同程度的急性损害，为器官损伤期。患者病情的轻重，主要与钩端螺旋体侵入量的多少，以及钩端螺旋体致病性的强弱密切相关。因此，针对钩端螺旋体的病原学治疗，是本病治疗的关键和根本措施，强调早期应用有效的抗生素治疗。

钩端螺旋体对多种抗生素敏感，如青霉素、庆大霉素、第三代头孢菌素和喹诺酮类药。与其他抗生素相比，青霉素不但毒性小，而且具有更强大的杀灭钩端螺旋体的作用。作为钩体病的首选药，青霉素常常进行肌肉注射治疗，疗程7天或至退热后3天。对青霉素过敏者可选用其他有效的抗菌药物，如多西环素、第三代喹诺酮类抗生素，如左氧氟沙星。使用青霉素后患者易发生赫氏反应，表现为患者突然出现寒战、高热，主要是由于大量的钩端螺旋体被杀死而引起，因此在治疗过程中，需警惕赫氏反应的发生。