得了肛门癌的初期，常常没有特殊的反应。病人出现的只是一些非典型症状，常常会和肛瘘、化脓性汗腺炎相混淆，随着肛门癌病变的发展，病人常常伴有肛门部位的不适和瘙痒的症状，在肛门的边缘，可以有肿物的生长。

刚开始的时候，疼痛会比较轻微，等癌症的病变侵犯到肛管，或者括约肌的时候，疼痛就会明显的加重，甚至是剧痛难忍，影响到病人的休息和睡眠。当肛门癌累及到括约肌的时候，病人还可以出现便意频繁、里急后重、排便困难、大便失禁的现象，同时还可以出现大便变细、变窄，粪便中可以有黏液和脓血。

此外，当肛门癌浸透了皮肤，可以造成皮肤的破溃，形成癌性的溃疡。而分泌物可以是血性的，也可以继发坏死、感染，或者是癌组织本身发生坏死，有脓性分泌物流出。癌性溃疡的周边往往是不规则的，可以形成环堤状的隆起，病人常常会合并有腹股沟淋巴结地肿大，这些肿大的腹股沟淋巴结往往质地比较硬，边界不清，表面也不光滑，可以互相融合成比较大的团块。