一般来说黏液性纤维肉瘤的预后与纤维肉瘤的恶性程度、病变侵及的范围，是否发生了淋巴结的转移和远处器官的转移是有关系的。同时黏液性纤维肉瘤病灶的大小，以及是否发生了组织坏死等情况都会影响到病人的生存。如果是早期的高分化的黏液纤维肉瘤，常常呈现低度恶性的过程，病变的增长相对是比较慢的。在经过了根治性手术切除治疗之后，病人可以活5年，甚至更长的时间，预后相对也是比较好的，甚至有一些病人在手术之后可能存活10年以上的时间。

如果是低分化的黏液性纤维肉瘤，属于恶性度比较高的肿瘤。如果这些恶性度高的低分化黏液性纤维肉瘤已经伴有了淋巴结转移，或者是已经伴有了远处器官转移，就常常已经失去了根治性手术切除的机会，只能采用化疗、靶向治疗的手段，来进行综合的治疗，控制病变发展的速度，减轻病人的痛苦。但整体来看，晚期的低分化的黏液性纤维肉瘤预后大多是比较差的。