病毒性结膜炎和细菌性结膜炎，区别首先从病原体上分，首先是不同的病原体，一类是病毒的，顾名思义，另外一类是细菌的。

一般病毒性的结膜炎，通常有可能会和伴有上呼吸道的感染，有上呼吸道最近感冒、上呼吸道的卡他症状。眼睛除了红出血，有水样的分泌物，有可能不是很严重，有清水样的分泌物。上呼吸道的卡他症状，鼻子鼻塞流涕，有可能会有淋巴滤泡增生，有可能是病毒性结膜炎的表现。

细菌性结膜炎的表现，通常会有黄色黏稠、黄色、脓性的分泌物，而且量比较大，眼睛表面被黄色的分泌物眼屎给糊住了可能是细菌性结膜炎。

细菌性和病毒性结膜炎并不是孤立的，有的时候有相互协同的作用，有的人细菌性结膜炎最开始有可能是病毒性结膜炎，后来继发细菌感染，是有可能的，而且在临床上并不少见。