卵巢囊肿手术如果怀疑良性，大多数会采用微创治疗，就是腹腔镜下的卵巢囊肿剥除术。

目前还有一种比较流行的手术方式就是经脐单孔腹腔镜，这种手术伤口一般比较小，在腹壁一般会有2-3个伤口，其中一个伤口只位于脐部，直径在1cm左右，另外两个伤口是在左下腹大约0.5cm。对于经脐单孔腹腔镜，伤口仅仅就一个，而且位于脐部，大约2-3cm。手术缝合以后，腹壁基本看不到有明显的伤口。对于卵巢囊肿比较大的患者，可能在脐部的伤口会向上延伸至脐上两指或者三指的位置，比较有利于腹腔镜镜体的进入。

对于卵巢囊肿怀疑有恶变的情况时，尤其是巨大的卵巢囊肿，术中如果行腹腔镜手术容易导致囊肿破裂，引起腹腔种植转移，医生一般会建议患者选择开腹手术，以免引起术中的破裂，引起囊肿、肿瘤的转移发生。卵巢囊肿的手术切口需要根据囊肿的良、恶性，以及患者的需求，还有医生的建议来综合进行选择。