非典病毒的传播途径包括呼吸道传播、消化道传播、直接传播以及其他传播途径。呼吸道传播是最主要的传播途径，短距离的飞沫传播是主要传播途径。

急性期患者咽拭子、痰标本中可以检测到SARS冠状病毒，病毒存在于患者的呼吸道黏液，或纤毛上皮脱落的细胞内，当患者咳嗽、打喷嚏或大声讲话时，飞沫直接被易感者吸入而发生感染。

飞沫在空气中停留的时间短，移动的距离约2m，故仅造成近距离传播。气溶胶传播是另一种方式，易感者吸入悬浮于空气中含有SARS冠状病毒的气溶胶而感染。

消化道途径传播也可以传播非典，患者粪便中可以检测出病毒RNA，通过消化道传播可能是另一种传播途径。通过直接接触患者的呼吸道分泌物、消化道排泄物、体液，或者间接接触被污染的物品也可以导致感染。

多个病例证实SARS可以通过实验室传播，实验室工作人员在处理或接触含SARS冠状病毒的标本时，未遵循严格的生物安全操作规程而感染。