流行性出血热的传播途径包括呼吸道传播、消化道传播、接触传播、垂直传播和虫媒传播。鼠类携带病毒的排泄物，如尿、粪、唾液等，以及排泄物污染尘埃后形成的气溶胶可通过呼吸道途径而感染人体。

进食被鼠类携带病毒的排泄物所污染的食物，可经口腔或胃肠道黏膜感染。被鼠咬伤或破损的伤口接触带病毒鼠类排泄物或血液后亦可导致感染。

孕妇感染流行性出血热后，病毒可经胎盘感染胎儿。曾从感染肾综合征出血热孕妇的流产儿的脏器中分离到汉坦病毒。尽管我国从恙螨和刺螨中分离到汉坦病毒，但其传播作用尚待进一步证实。

由于肾综合征出血热患者早期的血液和尿液中携带病毒，虽然有接触后发病的个别病例报告，但人不是主要的传染源。人群对出血热普遍易感，在流行区隐性感染率可达3.5%-4.3%。