反流性食管炎会引起咽喉部疼痛，反流性食管炎是胃内容物反流入食管引起的症状或并发症，常见的典型症状包括烧心和反流，亦可引起包括耳、鼻、喉等的相关症状，称为食管外症状。

当胃里面的反流物刺激到咽喉部，就会出现喉咙疼的症状，烧心和反酸是反流性食管炎最常见的典型症状，烧心是指胸骨后烧灼感，可从胸骨下段向上延伸，此外胸痛等也是反流性食管炎的常见症状。

部分患者返流症状不典型，可表现为上腹痛，上腹烧灼感，反食反胃，嗳气，吞咽困难等，如咽喉不适，咽部异物感，咳嗽哮喘和龋齿等。少部分患者以咳嗽与哮喘为首发或主要表现，反流引起的哮喘，无季节性，常有阵发性，夜间咳嗽与气喘的特点。

个别患者可发生吸入性肺炎，甚至出现肺间质纤维化。这是由于反流误吸入气道刺激支气管黏膜引起炎症和痉挛所致，反流物刺激咽、喉部可引起咽喉炎、声嘶，反流物侵蚀牙齿可引起龋齿。反流还可能导致鼻窦炎和反复发作的中耳炎并引起相关症状。