钩端螺旋体病的主要症状有发热、头痛、全身乏力、眼结膜充血、腓肠肌疼痛以及淋巴结肿大。

患者有不同程度的发热，发热多急性起病，伴畏寒或寒战，体温达到39℃左右，多为稽留热，热程约7天，亦可达10天。

头痛症状有时突出，可至恢复期仍有症状。全身肌肉酸痛明显，乏力显著，特别是腿软明显，甚至不能直立和行走。

发病第1天，患者即可出现眼结膜充血，以后迅速加重，也可发生结膜下出血。患者也可出现腓肠肌疼痛，轻者仅感小腿肿胀，轻度压痛，重者疼痛剧烈，不能行走，甚至拒按，有一定的特征性。

一般病后第2天即可出现淋巴结肿大，以腹股沟淋巴结肿大多见，其次是腋窝淋巴结，一般为黄豆或蚕豆大小，个别也可大如鸽蛋，质较软，有压痛，但无红肿和化脓。

其他还有咽部疼痛和充血、扁桃体肿大、软腭小出血点、恶心、呕吐、腹泻和肝脾轻度肿大。