伤寒最严重的并发症为肠穿孔，发生率1%-4%，常发生于病程2-3周，穿孔部位多发生在回肠末端，成人比小孩多见。

穿孔可发生在经过病原治疗，患者病情明显好转的数天内，穿孔前可有腹胀、腹泻或肠出血等前兆。

临床表现为右下腹突然疼痛，伴恶心、呕吐以及四肢冰冷、呼吸急促、脉搏细数、体温和血压下降等休克的表现，经过1-2h后，腹痛和休克症状可暂时缓解。

但是，不久体温迅速上升，腹痛持续存在并加剧，出现腹胀、腹壁紧张、全腹压痛反跳痛、肠鸣音减弱或消失、移动性浊音等阳性体征，白细胞较原先升高、腹部X线可见膈下游离气体。

患者出现肠穿孔后应该立即给予积极地治疗，局限性穿孔者应给予禁食，使用胃管进行胃肠减压。

除了对原发病给予有效的抗菌治疗以外，应加强控制腹膜炎症，如联合氨基糖苷类、第三代头孢菌素或应用碳青霉烯类抗菌药进行治疗。肠穿孔并发腹膜炎者应及时地进行手术治疗。