可以用来治疗直肠癌的药物有很多种，主要包括化疗药物、靶向治疗药物和免疫治疗药物。

化疗药物也包含了很多种类，主要包括卡培他滨、替吉奥胶囊、草酸铂、伊立替康、丝裂霉素、5-氟尿嘧啶，脱氧氟尿苷、喃氟啶等。以上药物往往两种或者三种组成联合的化疗方案，共同杀灭直肠癌的病变。

直肠癌的化疗需要根据分期的早晚，可能会应用在手术治疗之前，起到术前化疗的效果，使病变缩小，提高手术根治性切除的概率，也可以在手术之后进行术后的辅助化疗，进一步杀灭体内可能存在的残余的癌细胞，从而延缓术后复发现象的发生。

除了化疗药物之外，靶向药物也常常应用在直肠癌的治疗当中。如果基因检测显示ras基因是野生型，可以采用西妥昔单抗进行靶向治疗。如果ras基因是突变型，可以采用贝伐珠单抗进行治疗。

近年来随着免疫学的发展，免疫治疗药物也逐渐尝试应用在直肠癌的治疗当中，也取得了一定的疗效。