溃疡性结肠炎，一般用药时间在3-5年，患者要按医嘱服药，以及定期医疗随访，不要擅自停药，病情反复活动者应有终身服药的心理准备。

溃疡性结肠炎在明确诊断后主要治疗的药物，有传统的硫氮磺吡啶和其他各种不同类型5-氨基水杨酸制剂。糖皮质激素适用于对氨基水杨酸制剂，疗效不佳的轻、中度患者，对重度溃疡性结肠炎患者静脉糖皮质激素为首选治疗药物。

对病变局限在直肠或直肠乙状结肠者，强调局部用药。在直肠用栓剂，局限在直肠乙状结肠用灌肠剂，口服与局部用药联合应用疗效更佳，局部用药主要有美沙拉嗪栓剂、布地奈德泡沫剂等。免疫抑制剂如硫唑嘌呤或巯嘌呤适用于激素无效或依赖患者。

另外，还可以用生物制剂，如果出现大出血、穿孔、癌变、即高度疑为癌变可以行外科手术治疗。激素不能作为维持治疗药物，维持治疗药物选择视诱导缓解时用药情况而定，由氨基水杨酸制剂，或激素诱导缓解后用氨基水杨酸制剂维持，用原诱导缓解剂量的全量或半量。