伤寒的并发症有肠出血、肠穿孔、中毒性肝炎、中毒性心肌炎，以及支气管肺炎。肠出血为最常见的严重的并发症，多出现在病程第2到第3周，发生率2%-15%，成人比小儿多见。

常有饮食不当、活动过多、腹泻，以及排便用力过度等诱发因素。大量出血时常表现为体温突然下降、头晕、口渴、恶心和烦躁不安等症状。

体检可发现患者有面色苍白、手足冰冷、呼吸急促、脉搏下降、血压下降等休克的体征。

肠穿孔为最严重的并发症，发生率约为1%-4%。常发生于病程第2到第3周，穿孔部位多发生在回肠末端，成人比小儿多见。

穿孔前可有腹胀、腹泻或肠出血等前兆。临床表现为右下腹突然疼痛，伴有恶心、呕吐，以及四肢冰冷、脉搏细数、体温和血压下降等休克的表现。

患者可以出现腹痛持续性地加剧，出现腹胀、腹壁紧张、全腹压痛和反跳痛。