百日咳的治疗包括一般治疗和对症治疗以及抗菌治疗。

1、一般治疗和对症治疗按呼吸道传染病隔离，保持室内安静、空气新鲜和适当的温度、湿度。半岁以下的婴儿常突然发生窒息，应有专人守护。

2、痉咳剧烈者给予镇静药，如苯巴比妥钠、地西泮等，沙丁胺醇亦能减轻咳嗽，可以试用。

3、百日咳鲍特菌对大环内酯类抗生素较敏感，治疗的目的是清除鼻咽部的病原体，减少传播，通常不能缩短病程。早期治疗可以降低重症患者的死亡率。阿奇霉素、罗红霉素和克拉霉素等不良反应较少。此外复方磺胺甲恶唑亦可应用，疗程为2周。

百日咳是由百日咳鲍特菌引起的急性呼吸道传染病，病程较长，未经治疗，咳嗽症状可以持续2-3个月，故名百日咳。临床特点为阵发性、痉挛性的咳嗽，以及咳嗽终止时伴有鸡鸣样吸气吼声为特征。