巧克力囊肿吃中药不来月经，可以用活血化瘀通经的药物促进来月经，也可以吃黄体酮胶囊，使得子宫内膜脱落促进来月经。

一般来讲，巧克力囊肿实际上属于子宫内膜异位症的一种，也就是说子宫内膜异位到卵巢，伴随着每次月经周期，在卵巢部位形成血性的囊性包块，随着病程的逐渐发展，囊肿的体积会逐渐增大，临床表现主要是痛经，而且痛经的特点是渐进性加重，痛经的程度从无到有，从轻到重，是逐渐加重的过程。

一般吃中药针对巧克力囊肿，实际上应多用一些活血化瘀、散结消肿通络的药物，帮助巧克力囊肿吸收，一般情况下不会影响月经。除非患者在巧克力囊肿的同时，还伴有卵巢功能减退，影响子宫内膜生长，有可能会导致月经延后，或者是月经量减少，可以加重凉血活血的药物，或者是使用黄体酮类的药物，定期撤退子宫内膜，能让患者定期来月经。