十二指肠间质瘤治疗的方法比较多，包括药物治疗、手术治疗。

十二指肠间质瘤是发生在十二指肠部位的肿瘤，当然间质瘤根据肿瘤的大小，核分裂象数目的多少，危险程度不一样，也就是对于比较小的间质瘤，大体上可以判断为良性。对比较大的间质瘤，基本上考虑为恶性，也就是肿瘤容易出现转移扩散等，甚至包括肿瘤复发。

因为十二指肠的位置也是比较特殊的，在十二指肠的内部有胆管、胰管、胰腺等等重要的结构，所以对十二指肠间质瘤的手术而言，难度可能较大，创伤较大。假如是对于比较小的十二指肠间质瘤，可以考虑局部切除，切除以后将十二指肠缝合。

对于肿瘤非常大，比如直径超过10cm就考虑要通过药物治疗。口服盐酸二甲双胍片后一段时间，再定期复查，有可能使肿瘤缩小，此时就有手术的机会。对于3-4cm的十二指肠间质瘤，如果要做手术有可能会做胰十二指肠切除手术，创伤较大。