先兆流产的原因可以有许多方面，包括胚胎方面的因素，还有母体方面的因素，另外还有环境的因素，胚胎方面的因素主要是包括胎儿染色体的异常情况，另外在胎儿宫内有感染的情况也会引起流产。

母体方面的因素也比较多，比如说有全身性的疾病，内分泌方面的异常、免疫功能的异常、生殖器官异常等等，还包括不良习惯、全身性疾病。主要是一些感染性疾病，特别是胎儿在宫内感染，内分泌异常最为常见的就是黄体功能的不足。

除了黄体功能不全以外，甲状腺功能的低下，或者是孕妇糖尿病没有得到很好控制，也容易发生流产。免疫方面的因素主要是妇女存在免疫方面的疾病。生殖道的异常，包括子宫有畸形、子宫发育不良，子宫畸形又包括单角子宫、子宫纵膈或子宫粘连等。不良习惯主要就是包括吸烟、饮酒、环境的因素，主要是工业的废弃物等污染。这些原因都有可能导致先兆流产的发生。