慢性肾功能衰竭的治疗主要分为针对病因的对因治疗和对症治疗，因为引起慢性肾功能衰竭的基础疾病不同，包括慢性肾小球肾炎、糖尿病肾病、高血压肾病、梗阻性肾、，药物性肾损伤等。

由于不同的原发病导致的慢性肾功能衰竭。在治疗过程中，首先要针对病因施治。慢性肾小球肾炎引起的肾功能衰竭，有些是由免疫因素引起，例如IgA肾病这种情况下，会选择使用激素免疫抑制剂等治疗。

糖尿病肾病首先要控制血糖，延缓尿蛋白的漏出从而避免肾功能衰竭的进展加重。高血压肾病也要很好地控制血压，延缓慢性肾脏病的进展。

梗阻性肾病、药物性肾损伤根据不同的病因需要选择不同的治疗方案。而慢性肾功能衰竭的对症治疗，考虑需要慢性肾脏病一体化治疗。

对于有高血压的患者，需要选择合适降压药控制血压达标。有继发贫血使用促红细胞生成素纠正贫血。对于合并代谢性酸中毒的患者，纠正酸中毒还有合并其他疾病，也需要对症治疗。