矮小症的治疗方式主要取决于导致矮小症的原因，目前导致矮小症的常见原因是生长激素缺乏症，生长激素缺乏症的患者，通常可以使用生长激素进行皮下注射，通过补充生长激素来进行治疗。

在使用生长激素之前，矮小症的患者需要进行生长激素激发试验，了解生长激素是部分缺乏，还是完全缺乏，如果确实存在生长激素的部分或者是完全缺乏，则可以使用生长激素替代治疗。

在治疗的过程中，一定要监测患者身高增长的幅度及绝对值，还要监测甲状腺功能，监测IGF-1的水平，以及观察患者是否有脊柱侧弯等。

患者也要关注矮小症是否是其他原因所导致，比如有些患者是生长激素受体出现异常，这时单纯补充生长激素并不会有良好的效果，需要进行IGF-1的补充才能够纠正矮小症。

汗腺矮小症是与甲状腺功能相关的疾病，是由甲状腺激素缺乏导致，这类患者会出现矮小以及神经系统发育迟缓，需要补充左甲状腺素钠进行治疗。