卵巢囊肿如果是恶性，也许就是平常所涉及到的卵巢癌之类的一种卵巢肿瘤，这种要做全面分期的手术，手术范围比较大。

如果平常检查发现了卵巢囊肿有恶性的可能性，一般会选择做一侧的卵巢切除。手术中需要做初步评估，评估包括囊肿的表面是否有破口、表面是否有赘生物，以及与腹腔内的情况等进行综合判断。

另外，会把这一侧的卵巢送去做病理化验，判断是不是恶性。如果是恶性，综合手术中探查的情况，如果是很早期的恶性卵巢肿瘤，对于年轻女性，可以考虑做一侧卵巢和输卵管的切除。

手术后再根据最终的确诊病例报告而制定下一步治疗方案，这样的好处是保留了另一侧的卵巢，留给年轻的女性生育的可能性。但如果是评估卵巢囊肿是恶性的，而且已经发生了局部或者远处转移，此时手术肯定要做，并且手术范围也很大。是在目前医疗水平之下，唯一可行的、比较确切的初步诊断的治疗方案。