新生儿巨细胞病毒感染的临床表现会根据感染途径的不同而略有不同，感染途径主要包括先天性感染，即宫内感染，以及出生时或出生后感染两种，摄入带病毒的母乳是生后感染的重要途径。

一、先天性感染(宫内感染)

1、母为原发感染时30%-50%的胎儿被感染，可引起流产死胎、死产、早产、宫内发育迟缓，其中10%-15%的新生儿出生时出现多器官多系统受损的症状和体征，20%-30%于新生儿期死亡，主要死于弥散性血管内凝血、肝衰竭或继发严重细菌感染。

10%以上死于生后第1年，60%-90%留有后遗症，其中神经系统后遗症高达50%-90%，85%-90%出生时无症状的亚临床感染者中，10%-15%以后出现后遗症。

2、母为再发感染时，仅0.5%-3%的胎儿被感染，其中的新生儿出生时无临床症状，但亚临床感染病例中，10%-15%有后遗症，且多限于听力受损。如听力障碍早期进行干预，则智力发育不受影响。

3、常见的临床症状有黄疸肝脾大肝功能损害、呼吸宭迫、间质性肺炎、心肌炎、皮肤瘀斑、血小板减少、贫血、脑膜脑炎、小头畸形脑室周围钙化、脑室扩大等。

4、常见的后遗症有感觉性神经性耳聋智力运动发育障碍，甚至脑性瘫、癫痫、视力障碍、牙釉质钙化不全、支气管肺发育不良等。其中感觉性神经性耳聋是最常见的后遗症(出生时无症状者发生率为10%-15%,症状性高达60%),多在1岁左右出现，常为双侧性，并呈进行性加重。

5、新生儿出生后2-3周内病毒学检查阳性。

二、出生时或出生后感染潜伏期为4-12周，多数表现为亚临床感染。新生儿期主要表现为肝炎和间质性肺炎，足月儿常呈自限性经过，预后一般良好。早产儿还可表现为单核细胞增多症、血液系统损害、心肌炎等，死亡率高达20%。输血传播可引起致命性后果。

母孕期初次感染(原发感染)或母孕期免疫力下降潜伏感染重新激活(复燃)和不同抗原巨细胞病毒感染时(又称再发感染),病毒通过胎盘感染胎儿称先天性感染。新生儿出生时经产道吸入含巨细胞病毒的分泌物为出生时感染。出生后不久接触母亲含有巨细胞病毒的唾液、尿液、摄入带病毒的母乳、输血引起的感染称出生后感染。