全层角膜移植术的主要并发症包括切口渗漏、原发性移植片内皮功能衰竭、前房消失、免疫排斥反应、移植片上皮缺失、感染、术后角膜散光、角膜新生血管。

1.切口渗漏：表现为浅前房和眼压偏低，荧光素染色检查更容易发现渗漏。可沿穿透性缝线隧道渗漏，也沿植片切口渗漏。一般通过戴软性接触镜，或双眼加压包扎，当内皮覆盖内皮面的缝线时，伤口渗漏即可消失。如果是伤口对合不良，经过双眼加压包扎2~3天后，前房仍不形成者，则补充缝合伤口渗漏区。

2.原发性移植片内皮功能衰竭：可见术后早期角膜植片即已呈明显水肿混浊，且为不可逆性改变。其发生和供体材料不佳、术中严重损伤内皮有关。如在术后10天内植片完全混浊，应及时更换植片，以免植床发生反应性水肿，不利手术缝合。

3.虹膜前粘连：可引起继发青光眼或增加移植免疫排斥反应的发生率。小范围前粘连，如无不良后果可不予处理；范围较大或引起继发性青光眼时，应行粘连分离术。

4.前房消失：常由于切口渗漏或脉络膜脱离所引起，前房消失易导致移植片内皮损伤、虹膜前粘连等严重并发症。出现后切口渗漏者可参照上述方法处理；由脉络膜脱离导致者，可口服皮质类固醇，加压绷带包扎患眼，若无效，在脉络膜脱离区的巩膜相应部位切开巩膜放液，并由角膜缘作小切口注入透明质酸钠以重建前房。

5.免疫排斥反应：免疫排斥反应是全层角膜移植术失败的主要原因，发生率为10%~75%。免疫排斥反应发生的时间一般在术后2周至1年，其中3～6个月是免疫排斥的高峰，以后逐渐下降。对于急性免疫排斥反应，可增加糖皮质激素、免疫抑制剂等抗免疫排斥反应药物的使用频率；对于慢性排斥反应，注意消除引起排斥反应的病因和控制原发病，拆除缝线，并嘱注意休息，忌吃辛辣刺激性食物，适当应用抗排斥药物。

6.移植片上皮缺失：发生和术前供体保存不当或时间过长，以及术中损伤上皮、术眼倒睫、睑内翻等有关。应进行病因治疗，如处理倒睫或脸内翻等，同时点用人工泪液及胶原酶抑制剂，此外尚可使用角膜上皮生长因子药物。如以上治疗无效，应及时做睑缘缝合术。

7.感染：手术前后各个环节的污染均可能导致感染，如供体材料不洁、术眼本身存在的感染性病灶、术中污染、术后感染等。轻者为缝线区局部感染，重的为角膜炎甚至化脓性眼内炎。感染重在预防，如严格执行无菌操作、加强术后护理等。出现缝线局部感染者，拆除该处缝线，点抗生素眼药水或加结膜下注射抗生素，角膜炎或化脓性眼内炎则进行疾病治疗。

8.术后角膜散光：散光主要与手术技术有关，其处理可待拆线后6个月再根据散光度数的高低作角膜手术矫治。

9.角膜新生血管：如新生血管生长至移植片边缘，角膜伤口已愈合者，可及时拆除此处缝线，并滴用类固醇滴眼药水，可有效制止新生血管的进一步生长。