经肛门直肠肿瘤切除术的并发症主要有肛门出血、感染、直肠皮肤瘘以及尿潴留，通常在有经验的医生操作下有助于降低并发症的发生率。

1.肛门出血：该手术后比较常见的并发症是肛门出血，其原因通常是因缝合技术不当或是缝合时张力过大等导致缝合的创口渗血或出血。少量的出血（<10ml/次）可以采用保守治疗，大量的出血（>100ml/次）建议立即外科干预，在这两者之间可采取保守治疗下的密切观察。外科干预通常在直肠镜或乙状结肠镜下检查缝合的创口，对于渗血或出血的部位用电凝或缝扎均可，采用正确的缝合技术和避免张力缝合是预防该并发症的关键。

2.感染：手术切口感染非常常见，围术期应注意术前充分的肠道准备和术中严格的无菌操作，以及预防性抗生素的应用，可有效预防术后伤口感染。若出现感染，及时运用药物进行抗感染治疗，切口感染严重者应拆除感染部位缝线，彻底清除脓性分泌物，待感染控制后再行缝合。

3.直肠皮肤瘘：直肠皮肤瘘多发生在切开后又被修复缝合的直肠后壁，其中有伤口感染累及直肠后壁的原因，也有缝合技术不当的原因，因此需预防切口感染，并采用正确的缝合技术，以预防术后直肠皮肤瘘为主。

4.尿潴留：若在进行直肠切除时损及支配膀胱收缩的神经或直接导致膀胱损伤，可能出现尿潴留，需术中小心操作，术后若出现尿潴留，优先采取听流水声、小腹热敷等方法诱导排尿，必要时留置导尿管。