先天性动脉导管未闭是指出生一年后动脉导管未关闭，持续开放并产生病理生理改变的循环系统疾病，需要与先天性主动脉-肺动脉间隔缺损、主动脉窦动脉瘤破入右心、冠状动静脉瘘进行鉴别。

1、先天性主动脉-肺动脉间隔缺损：为胎儿期主动脉隔发育不全，使主动脉-肺动脉间隔处留有缺损所致。鉴别诊断方法是右心导管检查时心导管由肺动脉进入主动脉的升部。逆行升主动脉造影见升主动脉与肺总动脉同时显影。二维超声心动图见肺总动脉和主动脉均增宽，其间有缺损沟通，也有助于诊断。

2、主动脉窦动脉瘤破入右心：由先天性畸形、梅毒或感染性心内膜炎等原因所产生的主动脉窦部动脉瘤，可侵蚀并穿破至肺动脉、右心房或右心室，从而引起左至右的分流。其连续性机器声样杂音与动脉导管未闭极相类似，但位置较低一二肋间。本病多有突然发病的病史，如突然心悸、胸痛、胸闷或胸部不适、感觉左胸出现震颤等，随后有右心衰竭的表现，可助诊断。

3、冠状动静脉瘘：指冠状动脉及其分支与任一心腔或冠状窦及其静脉属支、近心大血管（如肺动脉、肺静脉、上腔静脉）之间存在的异常交通。多数患者在查体时发现心脏连续性杂音，进行冠状动脉造影检查可与动脉导管未闭鉴别。