睡眠-觉醒节律障碍的病因包括时区变化、激素水平、例行改变等，具体如下：

1、时区变化：飞机乘务人员、跨时区旅行者由于跨时区的影响，会直接导致睡眠-觉醒节律障碍的症状出现。

2、激素水平：人体由于受到体内激素分泌变化影响，常常会引起睡眠-觉醒节律障碍的发生。如怀孕、激素药物、绝经等。

3、例行改变：人体例行生物钟一旦受到外界因素影响而发生变化时，常会伴随有睡眠-觉醒节律障碍的情况发生。

4、疾病影响：某些疾病患者往往会伴随有睡眠-觉醒节律障碍的情况，其中包括阿尔茨海默氏病、帕金森氏病等。

5、心理健康问题：人体处于亢奋、压抑、焦虑等情绪状态下，会直接导致暂歇或持续性睡眠-觉醒节律障碍的情况。

4、不良习惯：长期熬夜、嗜睡等不良生活习惯，会直接导致人体生物钟发生絮乱症状，最终演变为睡眠-觉醒节律障碍。