十二指肠憩室的并发症有憩室炎和憩室出血、憩室穿孔、十二指肠梗阻、胆胰管梗阻、肠石。

1、憩室炎和憩室出血：由于十二指肠憩室内容物潴留，消化液引流不畅，容易导致细菌繁殖，引起局部细胞水肿、出血、坏死，造成炎性感染，并发憩室炎，严重者可继发憩室出血；或者由于炎症导致周围组织血管破裂，引起大出血，少数患者憩室黏膜恶性病变而导致憩室出血。

2、憩室穿孔：由于憩室内容物堆积，黏膜炎性糜烂，即而溃疡，最后形成憩室穿孔，多位于腹膜后，穿孔后症状不典型，不易发现。

3、十二指肠梗阻：可分为腔外型憩室和腔内型憩室导致。由于治疗不及时，内容物潴留，十二指肠憩室逐渐增大，压迫十二指肠，导致梗阻发生，主要是由腔外型憩室引起；腔内型憩室是因憩室充盈形成息肉样囊袋而阻塞肠腔，导致十二指肠梗阻。

4、胆胰管梗阻：多见于乳头旁憩室，由于十二指肠乳头附近是血管、胆管、胰管穿透肠壁部位，肌层薄弱，肠内压增高，易形成憩室，故而乳头旁憩室可压迫总胆管或胰管，致胆汁、胰液排出障碍，导致胆胰管梗阻，甚至出现逆行感染引起胆管感染或胰腺炎。

5、肠石：当憩室颈部狭窄时，食物一旦进入，就很难排出，长此以往，可形成肠石。