肝海绵状血管瘤需要与原发性或转移性肝癌、肝棘球蚴病、肝非寄生虫囊肿、其他肝腺瘤、肝血管内皮细胞肉瘤进行鉴别。

1、原发性或转移性肝癌：原发性肝癌多有慢性乙型肝炎、肝硬化的病史，有肝功能异常和甲种胎儿球蛋白（AFP）升高，对于甲种胎儿球蛋白（AFP）不高的原发性肝癌患者可通过病史、体检以及超声、CT等检查来鉴别。CT平扫为低密度灶，无包膜边界不清，增强扫描病灶不均匀增强，均支持原发性肝癌，如大病灶中心坏死出血也可致密度不均。转移性肝癌，多为多发，有消化系统原发灶。

2、肝棘球蚴病：病人有牧区生活史，有羊、犬接触史，肝包虫皮内试验阳性，嗜酸性细胞计数增高。

3、肝非寄生虫囊肿：孤立单发肝囊肿易与肝海绵状血管瘤鉴别，只有少数多囊肝有时可能与肝海绵状血管瘤混淆，多囊肝50%以上合并多囊肾，病变自开始即为多发性，大多满布肝脏，超声、CT示病变为大小不等、边界光滑、完整的囊腔，可能有家族遗传因素。

4、其他肝腺瘤、肝血管内皮细胞肉瘤：均少见，前者虽发展也缓慢，但肿块坚硬似橡皮;后者发展较快，具恶性肿瘤特征，多见于青少年。可通过影像学检查鉴别。