肝细胞癌需要与肝硬化结节、活动性病毒性肝炎、肝脓肿进行鉴别。

1、肝硬化结节：增强CT/MRI见病灶动脉期强化，呈快进快出，诊断肝细胞癌，若无强化，则考虑为肝结节，AFP>400ng/ml，有助于肝细胞癌诊断。

2、活动性病毒性肝炎：病毒性肝炎活动时血清AFP往往呈短期低浓度升高，应定期多次随访测定血清AFP和ALT，或联合检测其他肝细胞癌标志物并进行分析，如：①AFP和ALT动态曲线平行或同步升高，或ALT持续增高至正常的数倍，则肝炎的可能性大；②二者曲线分离，AFP持续升高，往往超过400ng/时，而ALT不升高，呈曲线分离现象，则多考虑肝细胞癌。

3、肝脓肿：临床表现为发热、肝区疼痛、压痛明显，白细胞计数和中性粒细胞升高。超声检查可发现浮肿的液性暗区。必要时在超声引导下做诊断性穿刺或药物试验性治疗以明确诊断。