高致病性禽流感病毒感染需要与支原体肺炎、传染性非典型性肺炎、细菌性肺炎进行鉴别。

1、支原体肺炎：起病缓慢，潜伏期2-3周，以发热、咳嗽为主要表现，伴有乏力、头痛、咽痛、肌肉酸痛、食欲不振、腹泻等。病原学检查可帮助鉴别。

2、传染性非典型性肺炎（SARS）：发热为首发症状，体温一般大于38℃，常呈持续性高热，可伴有畏寒、肌肉酸痛、关节酸痛、头痛、乏力，也可出现咳嗽，多为干咳，少痰，少部分患者出现咽痛。病原学检查可帮助鉴别。

3、细菌性肺炎：主要表现为咳嗽、咳痰，痰量不一，多为脓性痰，金葡菌肺炎较典型的痰为黄色脓性；肺炎链球菌肺炎为铁锈色痰；肺炎杆菌肺炎为砖红色粘冻样；绿脓杆菌肺炎呈淡绿色。鉴别诊断主要靠病原学检查。