沙眼衣原体感染的并发症包括倒睫、角膜混浊、睑球粘连、结膜干燥症、慢性泪囊炎，出现时应引起重视。

1、倒睫：典型表现为流泪、畏光、眼痛、眼红、眼内持续性异物感、眼部分泌物增多等。另外由于睫毛长期刺激眼结膜，可导致结膜充血。

2、角膜混浊：表现为角膜透明度降低，浑浊，呈灰白色。可伴随眼痛、畏光、流泪及视力减退。

3、睑球粘连：眼睑与角膜、球结膜粘连，可出现复视、视力减退、眼球运动障碍等症状。

4、结膜干燥症：主要表现为眼干涩、结膜干燥、角膜干燥而混浊、畏光、眼痛、异物感，伴有夜盲、视力下降等。

5、慢性泪囊炎：表现为泪溢、内眦部少量分泌物、内眦部结膜、半月皱襞充血，挤压泪囊部可有浆液性、黏液性、脓性分泌物溢出。