反流性胆管炎的并发症，主要有胆管结石、继发性胆汁性肝硬化、胆管癌。

1、胆管结石：轻者症状不明显，常见症状为上腹部疼痛，亦可出现寒战、高热、黄疸的症状。随着病情的发展可导致急性梗阻性化脓性胆管炎、胆源性胰腺炎及胆汁性肝硬化等，甚至会引起胆管癌。

2、继发性胆汁性肝硬化：亦可称为阻塞性胆汁性肝硬化，由于胆管的机械性梗阻引起。前期症状与黄疸相似，随着病情加重，逐渐出现肝大、脾大、食管-胃底静脉曲张破裂出血、腹腔积液及脂肪泻等症状，这些症状的出现一般预示着病情的严重。

3、胆管癌：胃肠道内容物反复反流入胆管，刺激胆管壁明显增厚，管壁僵硬，直至出现癌变，一般表现为黄疸、大小便颜色改变、胆囊增大、胆道感染及出血等症状。一般以手术治疗为主，早发现早治疗，可取得较好的手术效果。