孤独症的病因尚不明确，可能与遗传因素、脑功能异常、孕期理化因子刺激因素有关。

1、遗传因素：孤独症谱系障碍的遗传度较高。

2、脑功能异常：孤独者患者部分脑区的功能存在异常，5-羟色胺等神经递质水平异常。

3、孕期理化因子刺激：环境中的有害因素可能在妊娠早期影响胚胎发育，增加孤独症患病风险。

此外，重金属污染、空气污染、母亲高龄孕妇等因素，可能增加患病几率。