睾丸畸胎瘤手术治疗包括保留睾丸术、根治性睾丸切除术以及腹膜后淋巴结清扫术。

1、保留睾丸术：对于术中快速冰冻病理切片检查结果显示为良性，且在有正常睾丸组织存在的时候，应当尽可能保存睾丸的形态与功能。

2、根治性睾丸切除术：术前检查提示睾丸畸胎瘤存在恶变的可能性，则术中病理冰冻切片取样时同时阻断精索血管，避免恶性的肿瘤组织扩散。病理确诊为恶性睾丸畸胎瘤者以完整地清除癌组织为目的，术中将病变的睾丸和周围可能浸润的组织切除。病理检查难以定性的睾丸畸胎瘤，现仍建议采用根治性切除睾丸治疗。

3、腹膜后淋巴结清扫术：对于可疑或者确诊为恶性畸胎瘤的患者行腹腔后淋巴结清扫术，防止因腹腔后淋巴结转移带来的不良后果。